Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms