Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Borcs6Q9D6W8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms