Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tube1Q9D6T1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms