Protein–RNA interactions for Protein: Q9D662

Sec23b, Protein transport protein Sec23B, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23bQ9D662 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Sec23bQ9D662 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23bQ9D662 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms