Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrameQ9D4Z5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 218.2 ms