Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf6Q9D4J7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf6Q9D4J7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms