Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F3

Fam90a1b, Family with sequence similarity 90, member A1B, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam90a1bQ9D4F3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam90a1bQ9D4F3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms