Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pabpc6Q9D4E6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc6Q9D4E6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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