Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sohlh2Q9D489 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms