Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D454 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D454 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D454 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D454 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D454 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D454 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D454 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D454 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D454 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D454 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D454 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D454 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D454 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D454 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D454 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D454 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D454 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D454 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D454 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D454 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D454 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D454 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D454 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D454 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D454 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D454 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D454 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D454 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D454 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D454 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D454 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D454 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D454 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D454 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D454 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D454 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D454 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D454 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D454 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D454 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D454 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D454 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D454 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D454 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D454 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D454 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D454 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D454 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D454 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D454 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D454 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D454 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D454 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D454 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D454 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D454 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D454 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D454 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D454 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D454 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D454 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D454 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D454 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9D454 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9D454 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9D454 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9D454 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9D454 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9D454 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D454 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D454 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D454 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D454 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D454 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D454 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D454 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D454 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D454 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D454 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D454 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D454 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D454 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D454 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D454 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D454 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D454 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D454 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D454 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D454 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D454 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D454 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D454 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D454 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D454 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D454 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D454 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D454 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D454 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D454 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms