Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933425L06RikQ9D3Z8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms