Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx29Q9D3S3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Snx29Q9D3S3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Snx29Q9D3S3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Snx29Q9D3S3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Snx29Q9D3S3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx29Q9D3S3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx29Q9D3S3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx29Q9D3S3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx29Q9D3S3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx29Q9D3S3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx29Q9D3S3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx29Q9D3S3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx29Q9D3S3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx29Q9D3S3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx29Q9D3S3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx29Q9D3S3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx29Q9D3S3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx29Q9D3S3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx29Q9D3S3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx29Q9D3S3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx29Q9D3S3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx29Q9D3S3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx29Q9D3S3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx29Q9D3S3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx29Q9D3S3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx29Q9D3S3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx29Q9D3S3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx29Q9D3S3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx29Q9D3S3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx29Q9D3S3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx29Q9D3S3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx29Q9D3S3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx29Q9D3S3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx29Q9D3S3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx29Q9D3S3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx29Q9D3S3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx29Q9D3S3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx29Q9D3S3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx29Q9D3S3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx29Q9D3S3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx29Q9D3S3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx29Q9D3S3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx29Q9D3S3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx29Q9D3S3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx29Q9D3S3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx29Q9D3S3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms