Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3H9

5530401A14Rik, RIKEN cDNA 5530401A14 gene, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5530401A14RikQ9D3H9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
5530401A14RikQ9D3H9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
5530401A14RikQ9D3H9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
5530401A14RikQ9D3H9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5530401A14RikQ9D3H9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5530401A14RikQ9D3H9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5530401A14RikQ9D3H9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5530401A14RikQ9D3H9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5530401A14RikQ9D3H9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5530401A14RikQ9D3H9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5530401A14RikQ9D3H9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5530401A14RikQ9D3H9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5530401A14RikQ9D3H9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
5530401A14RikQ9D3H9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5530401A14RikQ9D3H9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5530401A14RikQ9D3H9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5530401A14RikQ9D3H9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5530401A14RikQ9D3H9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5530401A14RikQ9D3H9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5530401A14RikQ9D3H9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5530401A14RikQ9D3H9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5530401A14RikQ9D3H9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5530401A14RikQ9D3H9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5530401A14RikQ9D3H9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5530401A14RikQ9D3H9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5530401A14RikQ9D3H9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5530401A14RikQ9D3H9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5530401A14RikQ9D3H9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5530401A14RikQ9D3H9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
5530401A14RikQ9D3H9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5530401A14RikQ9D3H9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5530401A14RikQ9D3H9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5530401A14RikQ9D3H9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
5530401A14RikQ9D3H9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms