Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms