Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms