Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms