Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M0

Exosc7, Exosome complex exonuclease RRP42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc7Q9D0M0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms