Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zbed3Q9D0L1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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