Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2e1Q9D0D5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms