Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pbdc1Q9D0B6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms