Protein–RNA interactions for Protein: Q9D035

Nkain1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain1Q9D035 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkain1Q9D035 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkain1Q9D035 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkain1Q9D035 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkain1Q9D035 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms