Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ9

Dnajc18, DnaJ homolog subfamily C member 18, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc18Q9CZJ9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms