Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Rrs1Q9CYH6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrs1Q9CYH6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms