Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssu72Q9CY97 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssu72Q9CY97 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms