Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXZ1

Ndufs4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, mousemouse

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs4Q9CXZ1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ndufs4Q9CXZ1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ndufs4Q9CXZ1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufs4Q9CXZ1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufs4Q9CXZ1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufs4Q9CXZ1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ndufs4Q9CXZ1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufs4Q9CXZ1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufs4Q9CXZ1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufs4Q9CXZ1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ndufs4Q9CXZ1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ndufs4Q9CXZ1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufs4Q9CXZ1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufs4Q9CXZ1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ndufs4Q9CXZ1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ndufs4Q9CXZ1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufs4Q9CXZ1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufs4Q9CXZ1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufs4Q9CXZ1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufs4Q9CXZ1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufs4Q9CXZ1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufs4Q9CXZ1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ndufs4Q9CXZ1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufs4Q9CXZ1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufs4Q9CXZ1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufs4Q9CXZ1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufs4Q9CXZ1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufs4Q9CXZ1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufs4Q9CXZ1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufs4Q9CXZ1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufs4Q9CXZ1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufs4Q9CXZ1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufs4Q9CXZ1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufs4Q9CXZ1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufs4Q9CXZ1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufs4Q9CXZ1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufs4Q9CXZ1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufs4Q9CXZ1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufs4Q9CXZ1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufs4Q9CXZ1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufs4Q9CXZ1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufs4Q9CXZ1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms