Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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