Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Prdm5Q9CXE0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Prdm5Q9CXE0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Prdm5Q9CXE0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Prdm5Q9CXE0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Prdm5Q9CXE0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prdm5Q9CXE0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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