Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXC3

Mgme1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgme1Q9CXC3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mgme1Q9CXC3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mgme1Q9CXC3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms