Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX00

Ist1, IST1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ist1Q9CX00 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms