Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxxc1Q9CWW7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms