Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Khdc3Q9CWU5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Khdc3Q9CWU5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Khdc3Q9CWU5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Khdc3Q9CWU5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Khdc3Q9CWU5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Khdc3Q9CWU5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Khdc3Q9CWU5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Khdc3Q9CWU5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Khdc3Q9CWU5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Khdc3Q9CWU5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Khdc3Q9CWU5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Khdc3Q9CWU5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Khdc3Q9CWU5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Khdc3Q9CWU5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Khdc3Q9CWU5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Khdc3Q9CWU5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Khdc3Q9CWU5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Khdc3Q9CWU5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Khdc3Q9CWU5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Khdc3Q9CWU5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms