Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930553M12RikQ9CUH1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms