Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms