Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR02

Tma16, Translation machinery-associated protein 16, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tma16Q9CR02 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms