Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PclafQ9CQX4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PclafQ9CQX4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms