Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX0

Otub2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otub2Q9CQX0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otub2Q9CQX0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Otub2Q9CQX0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Otub2Q9CQX0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Otub2Q9CQX0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otub2Q9CQX0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms