Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW2

Arl8b, ADP-ribosylation factor-like protein 8B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl8bQ9CQW2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arl8bQ9CQW2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Arl8bQ9CQW2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Arl8bQ9CQW2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Arl8bQ9CQW2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Arl8bQ9CQW2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arl8bQ9CQW2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arl8bQ9CQW2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arl8bQ9CQW2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arl8bQ9CQW2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arl8bQ9CQW2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms