Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms