Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ndufb9Q9CQJ8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ndufb9Q9CQJ8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms