Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudt21Q9CQF3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms