Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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