Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms