Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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