Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ82

Itgb3bp, Centromere protein R, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3bpQ9CQ82 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms