Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ36

Pole4, DNA polymerase epsilon subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole4Q9CQ36 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pole4Q9CQ36 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms