Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 218.6 ms