Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg3Q9CPX6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC21■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg3Q9CPX6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms