Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPT7

4930519G04Rik, RIKEN cDNA 4930519G04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519G04RikQ9CPT7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930519G04RikQ9CPT7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930519G04RikQ9CPT7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930519G04RikQ9CPT7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930519G04RikQ9CPT7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930519G04RikQ9CPT7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
4930519G04RikQ9CPT7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930519G04RikQ9CPT7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930519G04RikQ9CPT7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
4930519G04RikQ9CPT7 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930519G04RikQ9CPT7 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930519G04RikQ9CPT7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930519G04RikQ9CPT7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930519G04RikQ9CPT7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930519G04RikQ9CPT7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930519G04RikQ9CPT7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930519G04RikQ9CPT7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930519G04RikQ9CPT7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930519G04RikQ9CPT7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930519G04RikQ9CPT7 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930519G04RikQ9CPT7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930519G04RikQ9CPT7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930519G04RikQ9CPT7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930519G04RikQ9CPT7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms