Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms