Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn6Q99PL6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn6Q99PL6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn6Q99PL6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn6Q99PL6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn6Q99PL6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn6Q99PL6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn6Q99PL6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn6Q99PL6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn6Q99PL6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn6Q99PL6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn6Q99PL6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn6Q99PL6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn6Q99PL6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn6Q99PL6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn6Q99PL6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn6Q99PL6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn6Q99PL6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn6Q99PL6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn6Q99PL6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn6Q99PL6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn6Q99PL6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn6Q99PL6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn6Q99PL6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ubxn6Q99PL6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ubxn6Q99PL6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ubxn6Q99PL6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn6Q99PL6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms